病原物为水稻黄单胞菌水稻致病变种[Xtm-thomonasoryzaepv.oryzae（Ishiyama）Swings],变形菌门黄单胞菌属成员。
病菌菌体短杆状，两端钝圆，极生单鞭毛，不形成芽抱或荚膜，但在菌体表面有一层胶质分泌物（如图所示）。在固体培养基上的菌落蜜黄色或淡黄色，圆形，边缘整齐，质地均匀，表面隆起，光滑发亮，无荧光，有黏性。G-。好气性，代谢呼吸型。不水解淀粉和明胶；能使石蕊牛乳变红，但不凝固；不还原硝酸盐；产生氨和硫化氢，不产生呼噪；能利用蔗糖、葡萄糖、木糖和乳糖发酵产酸，但不产气。在含3%葡萄糖或20Mg/mL青霉素的培养基上不能生长。生长温度范围为5〜40°C,最适为26〜30°C。在无胶膜保护下致死温度为53C(lOmin),在有胶膜保护下为57°C(10min)。
在白叶枯病菌存在的场所，如病株的组织和谷粒、病区灌溉水或田水、病田土以及一些带菌杂草的根部等都可分离到白叶枯病菌的噬菌体。这种噬菌体对白叶枯病菌有一定的专化性。白叶枯菌的噬菌体在形态、物理性状、血清学特性和寄主范围等方面存在差异，可区分为不同类型。在白叶枯病的研究中，噬菌体可用于菌系区分、种子和其他材料带菌的监测、病菌的侵染来源研究以及病害发生趋势的预测等方面。
白叶枯病菌不同菌株间致病力有明显差异。根据在IR26、Javal4、南粳15、特特勃和金刚30等5个鉴别品种上的反应，我国白叶枯病菌可分为7个致病型。长江流域以北以II型和I型为主，长江流域以H、IV型为多，而南方稻区以IV型为多，在广东和福建还有少量的V型。
自然条件下，白叶枯病菌主要侵染水稻，也可侵染陆稻、野生稻、菱白和李氏禾、鞘糠草及程壳草等李氏禾属杂草，但不普遍。人工接种时还可侵染马唐、雀稗、狗尾草等禾本科杂草，但出现症状较水稻为迟。
在白叶枯病菌存在的场所，如病株的组织和谷粒、病区灌溉水或田水、病田土以及一些带菌杂草的根部等都可分离到白叶枯病菌的噬菌体。这种噬菌体对白叶枯病菌有一定的专化性。白叶枯菌的噬菌体在形态、物理性状、血清学特性和寄主范围等方面存在差异，可区分为不同类型。在白叶枯病的研究中，噬菌体可用于菌系区分、种子和其他材料带菌的监测、病菌的侵染来源研究以及病害发生趋势的预测等方面。
白叶枯病菌不同菌株间致病力有明显差异。根据在IR26、Javal4、南粳15、特特勃和金刚30等5个鉴别品种上的反应，我国白叶枯病菌可分为7个致病型。长江流域以北以II型和I型为主，长江流域以H、IV型为多，而南方稻区以IV型为多，在广东和福建还有少量的V型。
自然条件下，白叶枯病菌主要侵染水稻，也可侵染陆稻、野生稻、菱白和李氏禾、鞘糠草及程壳草等李氏禾属杂草，但不普遍。人工接种时还可侵染马唐、雀稗、狗尾草等禾本科杂草，但出现症状较水稻为迟。
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